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任丽丽

研究员
导师类别:博士生导师
性别: 女
学历:博士研究生
学位:博士

个人简介

现任中国医学科学院病原生物学研究所副所长,克里斯托弗·梅里埃实验室副主任,中国医学科学院呼吸道疾病病原组重点实验室(培育)主任,中国医学科学院医学病原微生物菌(毒)种保藏分中心主任。
入选2012年度教育部新世纪优秀人才培养计划和2021年度中组部高层次人才培养计划。牵头承担国家科技重大专项等多项课题。以第一和通讯(含共同)作者发表在Lancet、JAMA、Am J Respir Crit Care Med、Emerg Infect Dis、mSystems、和Clin Microbiol Infect等SCI收录杂志发表50余篇,被多部国际指南、专利和政策文件参引。是国家人间传染的病原微生物实验室生物安全评审专家委员会委员,任中华预防医学会生物信息学分会常委兼秘书长、中华预防医学会生物安全分会副主任委员、中国女医师协会公共卫生专业委员会副主任委员,是《中华实验和临床病毒学杂志》编、《病毒学报》、《中华微生物学与免疫学》和《中华预防医学杂志》编辑委员会委员。
研究成果入选“中国2020年度“中国十大医学科技新闻”、2020年度“十大医学进展”以及“中国2020年度重要医学进展“。获2015年和2016年教育部高等学校科学研究优秀成果奖科技进步二等奖和一等奖(第二完成人)等省部级奖4项。入选2022年科睿唯安全球高被引科学家以及斯坦福大学全球前2%顶尖科学家榜单、2017年度北京协和医学院优秀教师、2018年度中国医学科学院-梅里埃研究院青年科学家奖、2019年度中国女医师协会五洲女子科技奖基础医学科研创新奖和2023年北京市教育系统服务育人先锋。

研究方向

主要从事呼吸道感染病原组和致病机制研究

科研项目

1.    国家重点研发项目,植物乳杆菌GUANKE菌株抗新冠病毒作用研究(2023YFC0871200)2013.011-2013.12子课题负责人
2.    国家科技重大专项项目,急性呼吸道传染病病原谱和流行规律及重要病原变异变迁特征研究(课题编号2017ZX10103004),2017-2020  项目负责人
3.    国家科技重大专项项目,呼吸道感染病原体深度测序组学鉴定技术研究(课题编号 2018ZX10305409-001-002), 2018-2020  任务负责人
4.    北京市自然基金重点项目,基于纳米孔测序的病原体快速鉴定及应用技术研究(课题编号Z19J00057),2019-2023  子课题负责人
5.    国家科技重大专项项目,呼吸道病毒性传染病病原谱流行规律及变异研究(课题编号2012ZX10004-206),2012-2015  课题负责人
6.    国家科技重大专项项目,呼吸道病毒性传染病病原谱流行规律及变异研究(课题编号2009ZX10004-206),2009-2010   课题负责人

研究成果

# Co-first author; *Co-corresponding author
1.    He Y#, Ma W#, Dang S#, Chen L, Zhang R, Mei S, Wei X, Lv Q, Peng B, Chen J, Kong D, Sun Y, Tang X, Wu W, Chen Z, Li S, Wan J, Zou X, Li M, Feng T*, Ren L*, Wang J*. Possible recombination between two variants of concern in a COVID-19 patient. Emerg Microbes Infect. 2022 Dec;11(1):552-555. 
2.    Chang L, Zhao L, Xiao Y, Xu T, Chen L, Cai Y, Dong X, Wang C, Xiao X, Ren L*, Wang L*. Serosurvey for SARS-CoV-2 among blood donors in Wuhan, China from September to December 2019. Protein Cell. 2022 May 24;14(1):28-36.
3.    Wu M#, Liu J#, Wang X, Zhang X, Liang T, Chen L, Huang T, Li Y, Zheng C, Yang Y, Wang J, Yu X*, Guo L*, Yang J*, Ren L*. Profiling of SARS-CoV-2 neutralizing antibody-associated antigenic peptides signature using proteome microarray. Med Comm (2020). 2023 Sep 3;4(5): e361.
4.    Guo L#, Zhang Q#, Zhong J#, Chen L#, Jiang W#, Huang T, Li Y, Zhang Y, Xu L, Wang X, Xiao Y, Wang Y, Dong X, Dong T, Peng Y, Zhang B, Xie Y, Gao H, Shen Z*, Ren L*, Cheng T*, Wang J*. Omicron BA.1 breakthrough infections in inactivated COVID-19 vaccine recipients induced distinct pattern of antibody and T cell responses to different Omicron sublineages. Emerg Microbes Infect. 2023 Dec;12(1): 2202263.
5.    Zhang S#, Huang W#, Ren L#, Ju X#, Gong M#, Rao J#, Sun L, Li P, Ding Q*, Wang J*, Zhang QC*. Comparison of viral RNA-host protein interactomes across pathogenic RNA viruses informs rapid antiviral drug discovery for SARS-CoV-2. Cell Res. 2022 Jan; 32(1):9-23.
6.    Liu X#, Xu F#, Ren L#, Zhao F, Huang Y, Wei L, Wang Y, Wang C, Fan Z, Mei S, Song J, Zhao Z, Cen S, Liang C, Wang J*, Guo F*. MARCH8 inhibits influenza A virus infection by targeting viral M2 protein for ubiquitination-dependent degradation in lysosomes. Nat Commun. 2021 Jul 20;12(1):4427.
7.    Chang L#, Zhao L#, Xiao Y, Xu T, Chen L, Cai Y, Dong X, Wang C, Xiao X, Ren L*, Wang L*. Serosurvey for SARS-CoV-2 among blood donors in Wuhan, China from September to December 2019. Protein Cell. 2022 May 24; 14(1): 28-36.
8.    Pang X#, Ren L#, Wu S#, Ma W#, Yang J, Di L, Li J, Xiao Y, Kang L, Du S, Du J, Wang J, Li G, Zhai S, Chen L, Zhou W, Lai S, Gao L, Pan Y*, Wang Q*, Li M*, Wang J*, Huang Y*, Wang J*, COVID-19 Field Response Group, COVID-19 Laboratory Testing Group. Cold-chain food contamination as the possible origin of Covid-19 resurgence in Beijing.  Natl Sci Rev. 2020, 7(12), 1861–1864
9.    Han Z#, Rao J#, Xie Z#, Wang C, Xu B, Qian S, Wang Y, Zhu J, Yang B, Xu F, Lei X, Guo F, Zhao Z, Ren L*, Wang J*. Chemokine (C-X-C motif) Ligand 4 is a Restrictor of Respiratory Syncytial Virus Infection and an Indicator of Clinical Severity. Am J Respir Crit Care Med. 2020. 
10.    Ren L#, Wang Y#, Wu Z#, Xiang Z#, Guo L#, Xu T#, Jiang Y, Xiong Y, Li Y, Li X, Li H, Fan G, Gu X, Xiao Y, Gao H, Xu J, Yang F, Wang X, Wu C, Chen L, Liu Y, Liu B, Yang J, Wang X, Dong J, Li L, Huang C, Zhao J, Hu Y, Cheng Z, Liu L, Qian Z, Qin C*, Jin Q*, Cao B*, Wang J*. Identification of a novel coronavirus causing severe pneumonia in human: a descriptive study. Chin Med J (Engl). 2020.133(9):1015-1024.
11.    Huang C#, Wang Y#, Li X#, Ren L#, Zhao J#, Hu Y#, Zhang L, Fan G, Xu J, Gu X, Cheng Z, Yu T, Xia J, Wei Y, Wu W, Xie X, Yin W, Li H, Liu M, Xiao Y, Gao H, Guo L, Xie J, Wang G, Jiang R, Gao Z, Jin Q, Wang J*, Cao B*. Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China. Lancet. 2020, 395(10223):497-506. 
12.    Guo L#, Ren L#, Yang S#, Xiao M#, Chang D#, Yang F, Dela Cruz CS, Wang Y, Wu C, Xiao Y, Zhang L, Han L, Dang S, Xu Y, Yang Q, Xu S, Zhu H, Xu Y, Jin Q, Sharma L, Wang L*, Wang J*. Profiling Early Humoral Response to Diagnose Novel Coronavirus Disease (COVID-19). Clin Infect Dis. 2020: ciaa310.
13.    Li L#, Zhang W#, Hu Y#, Tong X#, Zheng S#, Yang J#, Kong Y#, Ren L#, Wei Q#, Mei H# Hu C#, Tao C#, Yang R#, Wang J#, Yu Y#, Guo Y, Wu X, Xu Z, Zeng L, Xiong N, Chen L, Wang J, Man N, Liu Y, Xu H, Deng E, Zhang X, Li C, Wang C, Su S, Zhang L, Wang J, Wu Y*, Liu Z*. Effect of Convalescent Plasma Therapy on Time to Clinical Improvement in Patients with Severe and Life-threatening COVID-19: A Randomized Clinical Trial. JAMA. 2020. e2010044. 
14.    Shen Z#, Xiao Y#, Kang L#, Ma W#, Shi L, Zhang L, Zhou Z, Yang J, Zhong J, Yang D, Guo L, Zhang G, Li H, Xu Y, Chen M, Gao Z, Wang J, Ren L*, Li M*. Genomic diversity of SARS-CoV-2 in Coronavirus Disease 2019 patients. Clin Infect Dis. 2020. Ciaa 203.
15.    Yu J, Qian S, Liu C, Xiao Y, Xu T, Wang Y, Su H, Chen L, Yuan B, Wang X, Xu B, Yang Y, Shen K, Xie Z, Ren L*, Wang J*. Viral etiology of life-threatening pediatric pneumonia: A matched case-control study. Influenza Other Respir Viruses. 2020. 14(4):452-459.
16.    Ren L#, Fan G#, Wu W#, Guo L#, Wang Y#, Li X#, Wang C, Gu X, Li C, Wang Y, Wang G, Zhou F, Liu Z, Ge Q, Zhang Y, Li H, Zhang L, Xu J, Wang C, Wang J*, Cao B*. Antibody Responses and Clinical Outcomes in Adults Hospitalized with Severe COVID-19: A Post hoc Analysis of LOTUS China Trial. Clin Infect Dis. 2020 Aug 25: ciaa1247.
17.    Zhou Z#, Ren L#, Zhang L, Zhong J, Xiao Y, Jia Z, Guo L, Yang J, Wang C, Jiang S, Yang D, Zhang G, Li H, Chen F, Xu Y, Chen M, Gao Z, Yang J, Dong J, Liu B, Zhang X, Wang W, He K, Jin Q, Li M*, Wang J*. Heightened Innate Immune Responses in the Respiratory Tract of COVID-19 Patients. Cell Host Microbe. 2020. 27(6):883-890. e2.
18.    Yu J#, Liu C#, Xiao Y#, Xiang Z, Zhou H, Chen L, Shen K, Xie Z*, Ren L*, Wang J*. Respiratory syncytial virus seasonality, Beijing, China, 2007–2015. Emerg Infect Dis. 2019, 25(6):1127-1135. 
19.    Xiao Y, Zhang L, Yang B, Li M*, Ren L*, Wang J. Application of next generation sequencing technology on contamination monitoring in microbiology laboratory. Biosafety and health. 2019, 1(1): 25-31.
20.    Ren L#, Zhang R#, Rao J, Xiao Y, Zhang Z, Yang B, Cao D, Zhong H, Ning P, Shang Y, Li M*, Gao Z*, Wang J*. Transcriptionally Active Lung Microbiome and Its Association with Bacterial Biomass and Host Inflammatory Status. mSystems. 2018, 3(5). pii:e00199-18.
21.    Yan F#, Xiao Y#, Li M, Zhang H, Zhang R, Zhou H, Shen H, Wang J, Li W*, Ren L*. Metagenomic Analysis Identified Human Rhinovirus B91 Infection in an Adult Suffered Severe Pneumonia. Am J Respir Crit Care Med, 2017, 195(11): 1535-1536. 

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授权发明专利

1. 王健伟,任丽丽,韩子泊. PF4的抗RSV应用. 授权日2021年12月3日,专利号ZL201710384729.7  授权公告号 CN108926707 B
2. 王健伟,任丽丽,刘怡玮,李建国,肖艳. 新型冠状病毒SARS-CoV-2 荧光定量PCR 检测方法及其应用,授权日 2023年3月14日,专利号 ZL202010215450.8,授权公告号:CN 111394513 B
3. 王健伟,赵振东,任丽丽,黄鹤,朱悦. 一种抗新型冠状病毒SARS-CoV-2的双特异中和抗体及其应用. 授权公告日:2023年09月05,专利号 ZL 2022 1 0315128.1., 授权公告号CN 114605555 B。

科技奖励

1. 王健伟, 任丽丽, 等. 重要和新发现呼吸道及肠道病毒的病原学研究及其应用. 2015年度高等学校科学研究优秀成果奖(科学技术)二等奖.
2. 金奇,任丽丽,等. 基于宏基因组学的新型病原体组合筛查鉴定实用技术体系及应用. 2016年度北高等学校科学研究优秀成果奖(科学技术)一等奖.

研究生培养

团队累计培养研究生、博士后20人次