2016年9月2日，中华医学会在我所组织进行了实验室现场评估工作。评估专家组由中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所董小平教授、解放军军事医学科学院杨瑞馥教授、第四军医大学徐志凯教授、北京大学公共卫生学院詹思延教授、河北医科大学任雷鸣教授组成，中华医学会相关部门工作人员，中国医学科学院科技管理处王健伟处长，重点实验室课题组长、正研究员，依托单位领导及相关行政部门负责人参加了会议。会议由董小平教授主持。

中华医学会张利平在讲话中介绍了此次评估工作的背景和目的。受国家卫生计生委委托，中华医学会作为第三方评估机构独立开展 2016 年度国家卫生计生委重点科研基地（包括重点实验室）的评估工作。此次评估工作是根据卫生部重点实验室管理办法所进行的五年为一个周期的常规评估。评估方案经由中华医学会和国家卫生计生委科教司反复沟通，并在征求专家意见的基础上形成。评估的目的是以评促建，通过梳理实验室总体情况，总结经验，发现问题，从宏观到微观对实验室建设、发展提出建议和意见。评估工作分会议评估、现场评估和综合评议三个阶段，其中第一阶段会议评估工作已于本年度6月份完成。依托于中国医学科学院病原生物学研究所的“卫生部病原系统生物学重点实验室”取得会议评估阶段小组（含18个重点实验室）第一名的好成绩。评估的第二阶段是现场评估，目的是根据前期评估申报材料和会议评估情况，对实验室进行现场考察，强化评估的准确、客观性。她最后强调了评估原则，要求所有专家坚持客观、独立、公平、公正的态度，认真完成此次现场评估工作。

按照此次评估工作的议程，会议首先由金奇研究员作为实验室主任和依托单位负责人就实验室的研究方向、组织架构及人员情况、承担科研项目、国际科技合作、各项研究情况、科技论文与奖励、人才引进与培养、技术平台、学术交流与合作、运行模式与管理机制、依托单位支持等情况等作了详细的汇报，并就与会专家提出的问题进行了认真解答。随后，专家组现场查看了实验场地、设备等情况，核实了实验室评估相关文件材料，并同科研人员进行了个别访谈。

与会专家组认为，实验室组建时间短，但是取得了一批高水平的科研论文、奖励等成果；在基础研究、流行病学研究、病原组学鉴定等方面取得了突出的成绩，在重大传染病疫情防控中发挥了重要的科技支撑作用，在满足国家和行业重大需求方面发挥了重要作用；依托单位领导有担当，勇做实事，依托单位给予了实验室大力支持。同时，专家也对实验室学科布局、开放交流等工作提出了中肯的建议和意见。

中国医学科学院科技管理处王健伟处长在讲话中指出，尽管实验室成立时间较短，但在各级部门和领导的支持下，实验室在面向国际前沿、服务行业重大需求等方面做出了突出的成绩，得到了专家和领导的肯定。此次评估工作的开展是对实验室上一阶段工作的考评，也是与管理部门和专家共同描绘实验室未来发展的良好契机，希望实验室下一阶段按照专家提出的意见和建议，继续加强实验室建设，凝练方向，完善硬件条件等，院校今后也会继续为实验室做好服务，给与支持，使实验室发挥更大作用，为服务国家重大需求做出更大贡献。