2025年2月19日我所吴志强团队与华东师范大学何桂梅团队联合在Molecular Biology and Evolution杂志在线发表了题为“Avian Migration-Mediated Transmission and Recombination driving the Diversity of Gammacoronaviruses and Deltacoronaviruses”的论文。

随着COVID-19等动物源性传染病的暴发，野生动物携带病毒的潜在风险受到越来越多的关注。蝙蝠、鼠类等野生动物是多种高风险病毒的天然储存宿主，而候鸟作为跨洲际迁徙的生物类群，可能在病原体的全球扩散中发挥了重要作用。研究团队围绕东亚-澳大利亚迁徙路线的重要经停站上海的崇明东滩湿地、九段沙湿地和南汇东滩湿地，以系统分析2019年4月-2023年4月期间迁徙鸟类群体的病毒组特征为基础，进一步研究了372份冠状病毒阳性样本。系统发育分析揭示这些病毒隶属于5个与鸟类相关的冠状病毒亚属，并展现出高度的遗传多样性与复杂的重组特征；为构建更全面的鸟类冠状病毒进化框架，研究团队整合全球范围内可获取的鸟类冠状病毒数据，通过本研究新发现的3种冠状病毒以及重新分类的1个病毒种，将鸟冠状病毒的种类由12种扩展至16种；研究进一步发现雁形目（Anseriformes）、鸻形目（Charadriiformes）和鹈形目（Pelecaniformes）的迁徙鸟类是Gamma和Delta冠状病毒的主要宿主，强调了候鸟的关键宿主地位，而家鸭（domestic ducks）在迁徙鸟类与非迁徙鸟类之间的病毒传播过程中发挥了重要的桥梁作用。该研究创新性地以一个采样点的长期监测反映了全球迁徙鸟类冠状病毒的复杂遗传进化和传播动态，为我国前瞻性预该类病毒的跨境输入和输出提供了数据和技术支撑。

图.鸟类冠状病毒遗传进化及跨种传播的示意图

该研究获得了国家自然科学基金（32172943, 32370176，82221004）、中国医学科学院医学与健康科技创新工程（2023-I2M-2-001，2022-I2M-CoV19-002，2021-I2M-1- 038）、国家重点研发计划（2022YFE0210300）、科技基础资源调查专项（2022FY100901）等项目的资助。我所吴志强研究员和华东师范大学何桂梅研究员为文章的共同通讯作者。华东师范大学博士研究生徐玉婷，我所助理研究员韩业林、博士研究生许盼盼、助理研究员周思宇为文章的共同第一作者。